Однією з умов сертифікації FSC є природне поновлення лісів. Відтак задля цього з кожної ділянки, на якій буде здійснюватися рубка, необхідно залишити певну кількість дерев різних порід, які і виконуватимуть функцію природного заліcнення. Дерева при цьому мають бути здоровими та з достатньо великою кроною, аби дати достатній приріст у майбутньому. Їх нумерують та ставлять на них відповідні позначки.
Головним мотивуванням лісової сертифікації є гарантія того, що ліси будуть відновлюватися після здійснення рубок, а найбільш цінні ліси будуть збережені для нинішніх і наступних поколінь.
